NGS(次世代シーケンサー)による
HLAタイピング
HLA遺伝子型 第3区域※1までの高解像度HLAタイピング
HLA-A,B,C,DRB1,DRB3/4/5,DQA1,DQB1,DPA1,DPB1(11座)を同時にタイピングします。
※1 HLA遺伝子型第3区域…アミノ酸変異を伴わない塩基置換(=同義置換)
NGSタイピングの特長
NGS法
検査原理
NGS法はDNAの持つ塩基(A,G,C,T,)を一つずつ認識し、 それぞれ違う色(A青、 G緑、 C黄、 T赤)を発光します。
色の違いを認識して塩基配列を決定することから、それぞれの塩基配列に基づきHLAアリルを決定します。
結果報告例
HLA Class Iはexon1-7を HLA Class IIはexon1-4を検査対象としているため、原則として、 第3区域までアリルを決定・報告します。
NGS専用の報告書式Luminex法
検査原理
従来Luminex法では図の通り、 HLAアリル特異的塩基配列()がビーズ()に固定されており、
その特異的塩基配列を持つDNAと結合し、光を発します。 その光の組み合わせでアリルを判定しています。
また、検出された組み合わせによっては、アリルを決定出来ない場合があります。
結果報告例
Luminex法では、 候補アリルの中から日本人に一般的なアリルを見なしで第2区域までを報告しています。
料金について
HLA-A,B,C,
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検査料金一覧表 |
検査期間
HLA遺伝子型検査(NGS法)は検査結果報告スケジュールを参照
検査に必要な検体
検体の種類 | 検体量 |
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2ml |
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1本 |
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20ng/uL(50uL以上) |
- 「ヘパリン加血」は使用禁忌です。
スワブは当方でご用意しています。
必要な場合は、 当研究所HPよりお申し込みください。
使用試薬・機器
主な使用試薬:SCISCO GENETICS社、Illumina社
使用機器:Illumina社(MiSeq)